¿QUÉ ES LA INFLUENZA?

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Una pantalla de activación de CRISPR identifica un factor de hospedaje inhibitorio del virus de la influenza pan aviar

El virus de la influenza A (IAV) es un patógeno que presenta riesgos significativos para la salud humana. Por lo tanto, es fundamental desarrollar estrategias para prevenir la enfermedad de la influenza. Se han realizado muchas pantallas de pérdida de función para identificar las proteínas del huésped requeridas para la infección viral. Sin embargo, no ha habido una pantalla sistemática para identificar los factores del huésped que cuando se sobreexpresan son suficientes para prevenir la infección. En este estudio, utilizamos la tecnología de activación CRISPR / dCas9 para realizar una pantalla de sobreexpresión de todo el genoma para identificar los factores de restricción de IAV. El golpe más importante de nuestra pantalla, B4GALNT2, mostró actividad inhibitoria contra virus de influenza con una preferencia de receptor de ácido siálico a2,3. De hecho, la sobreexpresión de B4GALNT2 evitó la infección de todas las cepas del virus de la gripe aviar analizadas, incluidos los subtipos H5, H9 y H7, que previamente han causado enfermedades en humanos. Por lo tanto, hemos utilizado la tecnología de activación CRISPR / dCas9 para identificar un factor que puede eliminar por completo la infección por virus de la influenza aviar.
Se han realizado varios tipos de pantallas para comprender los requisitos de infección viral, replicación o propagación. El trabajo previo sobre IAV se ha centrado casi exclusivamente en la pérdida genética de los estudios de función (es decir, pantallas de ARNi) identificando las proteínas del huésped que son necesarias para permitir la infección por IAV.
Si bien este trabajo ha sido fundamental para identificar los factores que permiten la replicación del virus, ha faltado una pantalla sistemática de sobreexpresión para identificar los factores del huésped que pueden inhibir la replicación del virus. El principal obstáculo para realizar pantallas de sobreexpresión ha sido la tecnología. Aunque en teoría se podrían realizar pantallas de sobreexpresión de ADNc, varias limitaciones importantes han impedido su uso generalizado: 
1.) Es costoso y difícil clonar o sintetizar todos los supuestos marcos de lectura abiertos (ORF) en el genoma humano,
2.) Es es difícil conocer o capturar la complejidad de la variación de la isoforma de la transcripción para un gen dado, 
3.) La expresión de los ADNc a menudo está limitada por restricciones de tamaño (por ejemplo, en vectores de expresión virales). 
Se ha demostrado que el trabajo reciente que modifica la tecnología CRISPR / Cas9 para reclutar activadores transcripcionales, llamado mediador de activación sinérgica CRISPR (CRISPR SAM), es eficaz para las pantallas de sobreexpresión del genoma completo.

En este trabajo, se ha adaptado la tecnología CRISPR SAM para detectar genes que, cuando se sobreexpresan, inhiben completamente la infección por IAV. Descubriéndose así  genes inhibidores, pero identificamos notablemente una glucosiltransferasa (B4GALNT2) que modificó el ácido siálico que contiene glicanos y previno la infección por cada cepa aviar de IAV probada. Por lo tanto, el uso de la tecnología de activación del gen CRISPR ha permitido la identificación de un gen del hospedador que potencialmente puede ser objetivo para prevenir las infecciones de influenza aviar.

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Net grafia:
NCBI  [Internet ] A CRISPR activation screen identifies a pan-avian influenza virus inhibitory host factor  [Citado 24 Dic 2017] Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5568676/ 

La terapia con células madre podría reducir las complicaciones respiratorias asociadas a la influenza

En un modelo murino de infección por influenza H5N1, el tratamiento con MSC condujo a una mejor supervivencia y patología de la enfermedad.
Actualmente, hay una falta de tratamientos efectivos para la lesión pulmonar aguda como resultado de infecciones de virus respiratorios. En este trabajo, los autores demostraron que las MSC, células madre multipotentes derivadas de la médula ósea, eran eficaces para resolver la patología relacionada con la lesión pulmonar asociada con la infección por la gripe H5N1.

En un modelo de cocultivo in vitro, las células epiteliales alveolares (AEC) se cultivaron con MSC humanas o fibroblastos de pulmón humano de control y se analizaron en cuanto a su capacidad para realizar funciones críticas del epitelio pulmonar. El co-cultivo con MSC condujo a una mejor capacidad para que los AEC transporten fluido desde su lado apical a su lado basal y aumenta la función de barrera de la monocapa de AEC contra el paso de solutos. En ratones ancianos infectados con el virus H5N1, el tratamiento con MSC humanas mejoró las tasas de supervivencia y disminuyó la pérdida de peso corporal como resultado de la infección. En comparación con los animales tratados con fibroblastos, los ratones inyectados con MSC tenían mejores funciones de transporte de fluidos y menos acumulación de proteínas en el líquido de lavado broncoalveolar.

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ADN recombinante

RECOMBINACIÓN GÉNICA

Una ejemplo de ADN recombinante, que ocurre normalmente en la naturaleza, es la Recombinación genética. La recombinación genética es un proceso que lleva a la obtención de un nuevo genotipo a través del intercambio de material genético entre secuencias homólogas de DNA de dos orígenes diferentes.
La información genética de dos genotipos puede ser agrupada en un nuevo genotipo mediante recombinación genética. Por lo tanto la recombinación genética es otra forma efectiva de aumentar la variabilidad genética de una población.

Tipos de recombinación genética



Existen varios tipos de recombinación genética, en las células eucariotas:

- Recombinación homóloga

- Entrecruzamiento cromosómico

- Recombinación específica de sitio

- Recombinación no homóloga
El entrecruzamiento cromosómico: Es el intercambio de material genético que se produce en la línea germinal. Durante la formación de óvulos y espermatozoides, un proceso también conocido como meiosis, los cromosomas emparejados de cada progenitor se alinean de manera que las secuencias similares de ADN de cada pare de cromosomas se puedan cruzar entre sí. El entrecruzamiento cromosómico genera una mezcla del material genético y es una causa importante de la variación genética observada en la descendencia.


 Producción de partículas similares a virus en el sistema de expresión de baculovirus A, contracción de baculovirus recombinante que expresa el gen del antígeno de influenza, B

El uso de baculovirus recombinantes para la expresión de proteínas del virus de la gripe en células de insectos da como resultado la acumulación de baculovirus, junto con la VLP, en el fluido de cultivo. Dado que estas estructuras son de tamaños similares, es difícil aislar VLP de partículas de baculovirus. La VLP de la gripe puede generarse en células de mamíferos utilizando otros vectores de ADN y virales. Por lo tanto, se ha diseñado un sistema para producir VLP de influenza en células Vero usando vectores de ADN que llevan los genes de las proteínas HA, NA, M1 y M2 del virus de la gripe. Se ha descrito el uso del virus de la vacuna modificado Ankara para generar VLP que contiene proteínas del virus de la gripe H5N1 (HA, NA, M1) en células de mamíferos. Estas VLP son capaces de inducir una respuesta inmune protectora en ratones  
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3548171/figure/F2/
 
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Net grafía:
  1. News Medical Lide Sciences  [Internet] ¿Cuál es DNA Recombinante? [ Actualizado May 4, 2015], [Citado 8 Dic, 2017] Disponible en: https://www.news-medical.net/life-sciences/What-is-Recombinant-DNA-(Spanish).aspx
  2. NCBI [Internet] Potential recombinant vaccine against influenza A virus based on M2e displayed on nodaviral capsid nanoparticles  [Citado 8 de Dic 2017 ] disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4396508/
 

Evaluación comparativa de la eficacia de IAVchip DNA Microarray en el diagnóstico de la gripe A




El documento describe la evaluación comparativa de microarrays de ADN IAVchip, PCR de transcripción inversa (RT-PCR) y RT-PCR en tiempo real frente al aislamiento de virus en embriones de pollo y muestra su eficacia diagnóstica en la detección y subtipificación del virus de la influenza A. Las pruebas se evaluaron con el uso de 185 especímenes de humanos, animales y aves. El microarray IAVchip DNA demuestra una mayor eficacia diagnóstica (99,45%) en el diagnóstico temprano de influenza A en comparación con la PCR en tiempo real (98,38%) y RT-PCR (96,22%), lo que demuestra su clara superioridad. La sensibilidad diagnóstica de IAVchip DNA microarray (100%) excede la misma de RT-PCR (95.95%) y RT-PCR en tiempo real (97.96%) en el intervalo de intervalos de confianza estimados.

 El microarreglo de ADN IAVchip y la RT-PCR en tiempo real mostraron la misma especificidad diagnóstica (98.85%), mientras que la especificidad diagnóstica de la RT-PCR fue del 96.40%. IAVchip DNA microarray tiene una ventaja sobre las otras pruebas para el diagnóstico de influenza A y la identificación del virus como un método más rápido que permite realizar la detección y subtipificación simultáneas de alrededor de decenas de especímenes en un experimento durante 8-10 horas. 





El microarray IAVchip DNA desarrollado es una herramienta de prueba general que permite identificar simultáneamente 16 subtipos de hemaglutinina (HA) y 9 neuraminidasa (NA) del virus de influenza A y también detectar virus de influenza A de humanos, animales y aves por genes M y NP.


Net grafía:
NCBI [Internet]Comparative Evaluation of Effectiveness of IAVchip DNA Microarray in Influenza A Diagnosis. [Actualizado 23 Nov 2014 ] [Citado 03 Dic 2017 ], disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4274914/