Ejemplo de alteración de la epigenómica en la influenza

La replicación del virus de la gripe en las células del huésped da como resultado la producción de mediadores inmunes como las citoquinas. Se ha observado una secreción excesiva de citoquinas (hipercitoquina) durante las infecciones por virus de la influenza aviar altamente patógena (HPAI-H5N1), lo que resulta en altas tasas de mortalidad.

El mecanismo exacto de la hipercitonemia durante la infección por el virus de la influenza aún no se conoce por completo. Como los cambios en la metilación del ADN del promotor están relacionados con los cambios de expresión en los genes, intentamos identificar si los cambios en la metilación del ADN del promotor tienen alguna función en la expresión de las citoquinas durante la infección por el virus de la gripe A.

Un panel de 24 genes de citocinas y genes que se sabe que están implicados en la respuesta inflamatoria se analizaron para determinar los cambios en la metilación del ADN del promotor durante las infecciones por el virus de la gripe A. Cuatro diferentes cepas de virus de influenza A, a saber. H5N1, H1N1, pandemia (2009) H1N1 y una cepa vacunal de H5N1 se usaron para el estudio.

 

Encontramos 7 de los 24 genes inflamatorios estudiados, que muestran cambios significativos en los niveles de metilación del promotor en respuesta a la infección por el virus. Estos genes incluyen citoquinas proinflamatorias CXCL14, CCL25, CXCL6 e interleucinas IL13, IL17C, IL4R. Los cambios en los niveles de metilación del ADN variaron entre diferentes cepas de virus de la influenza dependiendo de su virulencia. Se observó hipometilación significativa del promotor en los genes IL17C e IL13 en células infectadas con el virus HPAI-H5N1 en comparación con otros virus de influenza. Se encontró que esta disminución en la metilación se correlacionaba positivamente con la expresión incrementada de estos genes. El análisis de la región promotora de IL17C usando secuenciación de bisulfito dio como resultado la identificación de un sitio CpG dentro del sitio de unión del factor de transcripción del receptor Retinoide X (RXR-α) sometido a desmetilación específicamente en células infectadas con H5N1 pero no en otras células infectadas con influenza.

Net grafía:

NCBI. Sanjay Mukherjee Veena C. Vipat,  and Alok K. Chakrabarti. Infection with influenza A viruses causes changes in promoter DNA methylation of inflammatory genes [Internet] 2013. [Citado 11 Nov del 2017], disponible en:https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4634256/ 

Imagen 1:NCBI,Infection with influenza A viruses causes changes in promoter DNA methylation of inflammatory genes [Internet] 2013. [Citado 11 Nov del 2017], disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4634256/figure/irv12127-fig-0001/

Imagen 2:NCBI,Infection with influenza A viruses causes changes in promoter DNA methylation of inflammatory genes [Internet] 2013. [Citado 11 Nov del 2017], disponible en https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4634256/figure/irv12127-fig-0002/